参考文献

元ネタ論文
Probing rare physical trajectories with Lyapunov weighted dynamics(arxiv)
Identifying rare chaotic and regular trajectories in dynamical systems with Lyapunov weighted path sampling
Lorenz系,Chua回路の計算にはdeSolveを使いました。
MCMCによる軌道探索のコンセプトは@sfchaosさんのレプリカ交換モンテカルロ法を用いた力学系の軌道・パラメータ探索を参考にさせていただきました。
RcppSMCの使用方法については@teramonagiさんのRcppSCMパッケージを使って逐次モンテカルロ（Sequential Monte Carlo）・粒子フィルタ（Particle Filter)を実行する - My Life as a Mock Quantが参考になります。
Standard mapは時間発展に対する保存量(エネルギー)が存在する系です。そのような微分方程式や写像の数値計算をRで実装した例としてはハミルトン系の数値計算 (PRML11章) | singular pointが参考になります。