xiangze's sparse blog

機械学習、ベイズ統計、コンピュータビジョンと関連する数学について

stanでODEパラメーター推定を試す(その1)

基本的には
http://statmodeling.hatenablog.com/entry/sir-model-ode-1
と同じ内容なのですが、

  1. 時間の間隔を指定しなくてもよいのか
  2. transformed dataとして指定するx_i,x_tは必要か(stanを呼び出したコードからは見えない)

という(個人的な)疑問点に関する解答となっています。

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Tokyo.stanの感想

stan開発者の一員であるBetancourtさんを招いたTokyo.stanを聴きにいきました。
Michael Betancourt's Stan Lectureを開催しました - StatModeling Memorandum
自分はstanを余り使いこなせていないのですが、主にアルゴリズムと実装に関する感想を書きます。

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最近のpymcの進展(ノンパラベイズ)

pymcはpythonの文法の枠内で統計モデルが書けてMCMCを実行することで推定が出来るライブラリです。
最近開発に色々な進展があったので勉強しています。
https://pymc-devs.github.io/pymc3/

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「R言語徹底解説」をいただきました

R言語徹底解説」(原題 Adbanced R)を訳者の方からいただきました。ありがとうございます。
最初15章 DSLまで読もうとしましたが挫折したので3章 データ抽出について書きます。

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